创新机制体制，科技成果转化实现跨越式发展，成效显著形成良好范例
2015-2022年6月 已有70项技成果实现转化。
据中国科技评估与成果管理研究会、国家科技评估中心、中国科学技术信息研究所联合编著并发布的《中国科技成果转化年度报告》，上海药物所连续几年在全国高校院所以转让、许可、作价投资3种方式转化科技成果合同金额排名中名列前茅， 其中2018年排名全国第二，2019年、2020年蝉联全国第一。
知识产权产出保持良好态势，成为科技成果转化的“源头活水”
1985年4月1日——我国第一部《中华人民共和国专利法》正式实施的第一天，上海药物所递交了研究所第一份专利申请，并于1991年8月7日获得授权。1995年12月26日上海药物所提交了第一份PCT申请。研究所研发的1类新药盐酸安妥沙星，是1993年我国实施化合物专利保护以来，第一个由我国科学家创制的具有自主知识产权的化学创新药。
2015-2018年5月 上海药物所以53件小分子专利进入科睿唯安《生命科学创新报告》统计的世界（药物）小分子首次授权专利数量TOP20榜单（第16位，唯一上榜的中国研发机构），仅次于加州大学，在全球大学和研究机构中排名第二。
2020年 2020年11月，由上海科学技术研究政策所、上海技术交易所、科睿唯安、上海市教育委员会科技发展中心联合完成并发布的《2020长三角区域创新机构发展研究报告》，对江浙沪皖的高等院校、科研机构的创新产出——专利进行分析，并从发明数量、发明质量、影响力、协同创新、全球化等5个维度评估，上海药物研究所入选100强中的第一梯级；其全球化指标中，上海药物研究所位列第一，欧、美、日专利累计加总占比达到16.3%，远超入选100强的均值水平（高校0.9%，科研机构1.5%）。
技术服务支撑引领我国生物医药产业创新发展
上海药物所自建成创新药物研发综合性技术大平台以来，充分发挥其技术优势，为我国新药创制提供各类新药评价和技术服务，覆盖新药临床前研发全链条。近年来，除药物安全性评价、药物代谢研究、药效评价、制剂研究、固体化学与药物质量控制研究、中药研究等经典方向外，技术服务能力还延伸拓展至人工智能、生物影像、MOST、冷冻电镜、放射性药物、生物药物等新兴前沿领域。
2015-2022年6月 累计承担技术服务项目2700余项；据不完全统计，为我国在此期间获批上市的16个1类新药提供了单元或一体化的评价与服务。
