公共技术服务中心MOST及图像融合分析服务部于2025年9月承担“面向石蜡样本的fMOST系统优化及实时三维渲染软件开发”项目，经费52万元，已于2026年10月13日通过中国科学院上海生命科学大型仪器区域中心组织的项目验收。

荧光显微光学切片断层成像（fMOST）将机械切削与光学成像相结合，可在厘米级样本上实现亚微米级三维荧光成像，是整体组织器官高分辨三维成像的利器。我所以BioMapping 3000系列fMOST系统为基础，已将MOST技术用于病理学评价、药物分布与药效学三维评价等领域。但该技术长期存在两方面局限：一是样本兼容性受限，受切削硬度与荧光信号要求制约，仅适配树脂或冷冻包埋样本，临床最常用的石蜡样本因硬度低、浸蜡高温致荧光猝灭而无法直接上机；二是采集过程“盲测”，小鼠全脑连续采集需7至10天、数据量达TB级，传统流程须采完并经数日离线处理才能重建，操作者无法在采集中判断覆盖度与数据质量，一旦发现问题往往白白浪费时间和精力。

针对上述局限，项目组围绕“硬件改造、软件落地、应用验证”攻关：硬件上将3毫米金刚石刀具更换为10毫米宽刀，切割宽度由2.2毫米提升至9.5毫米，并改造水循环系统；同时利用fMOST实时复染技术改变样本依赖预标记的模式，在缓冲液中加入1微克/毫升碘化丙啶（PI），每层切削后新暴露的表面即时染色，实现石蜡样本“免脱蜡、免重包埋、免预处理染色”直接成像。软件上开发fMOST双通道实时三维渲染软件（fMOST_RT3D V1.0），以NVIDIA Quadro P1000 GPU为计算核心，将配准与拼接算法移植至CUDA并行框架，构建“采集—显存直通—增量配准—体渲染”流水线，支持双通道数据配准、独立渲染切换、实时增量更新与交互式浏览，并基于节点管线开发管腔结构可视化处理模块。

技术方案的有效性通过系统性的样本验证得到确认。项目组采集正常小鼠肺、肾、肝及肝脏胆管结扎（BDL）模型石蜡样本验证，四类样本均获完整三维重建，BDL模型清晰显示胆管增生三维网络与肝小叶空间变形。在此基础上形成《石蜡样本fMOST直接采集成像标准化操作流程》。经验证，石蜡样本可直接上机并经PI复染获得清晰胞体与组织结构，单层采集完成后软件5秒内即完成渲染更新，各项指标均达到实施方案要求。

项目取得计算机软件著作权1项（fMOST双通道实时三维渲染软件V1.0，软著登字第17964124号），撰写SCI论文1篇，目前投稿中。项目实施使fMOST平台具备临床石蜡样本直接三维成像与采集过程实时可视化能力，将“先采集、后重建”的串行流程优化为“边采边看”的并行模式。