战略布局，促进团队协同、产学研融合，推动成果产出与区域发展
2004年至2013年，蒋华良担任上海药物所副所长，为所平台建设和人才队伍建设作出了积极贡献。2013年至2019年担任所长期间，他引领研究所实现跨越式发展，完善创新体系，提升创新能力，推动化学药、中药及民族药、生物药多元发展，屡创进入临床研究阶段药物数量的新高。
2017年6月，时任药物创新研究院理事长相里斌（牌左）和时任药物创新研究院院长、副理事长蒋华良（牌右）
共同为“中国科学院药物创新研究院”揭牌
在科研管理与团队建设方面，蒋华良制定了一系列务实有效的具体措施，包括组织管理、人才评价、激励机制和团队建设等。首先，他改进了科研管理，实施以“以疾病为中心、领域首席科学家领衔、多学科协同”的大团队科研活动组织模式进行新药创制，推动科研、管理部门组织结构调整。同时，实行分类评价，打破“出论文”唯一标准，以“出新药”为目标，将临床批件、新药证书与职称评定挂钩，促进实际成果产出。在人才培养和仪器设备部署方面，蒋华良院士展示了敏锐的战略眼光，投入大量资金引进人才，配置冷冻电镜和高性能计算机等先进设备。
在科技战略规划与区域发展方面，他从维护人民健康、促进产业发展的国家重大战略需求出发，为医药产业谋划发展布局。他深度融入上海科创中心、长三角一体化和粤港澳大湾区等区域发展战略，推动研究所跨越发展。他深入推动产学研融合，领导和推进了张江药物实验室、苏州创新研究院等机构的建设，有力地促进了成果转移转化和地方生物医药产业发展。
