为了贯彻落实全国科技创新大会精神，充分发挥中国科学院研究所与高等学校双方的优势，促进科教结合协同育人，2012年中国科学院、教育部联合颁布实施《科教结合协同育人行动计划》。在“行动计划”的指导之下，中国科学院上海药物研究所（以下简称“上海药物所”）与合作高校的正规联合培养研究生工作逐步开展。

　　截止2020年9月，累计与110多所国内外高校合作完成了765名研究生的联合培养工作，其中硕士生636人、博士生129人；在读联合培养744人，其中博士生187人、硕士生557人。与复旦大学、上海科技大学、中国科学技术大学、上海大学、南昌大学、南京中医药大学、安徽中医药大学、江西中医药大学、中国药科大学、沈阳药科大学、遵义医科大学等国内等10余所高等院校建立了校所层面的合作项目。

　　上海药物所积极探索联合培养研究生新模式，构建“招生联动、学分互认、质量齐管、资源共享、待遇趋同”的新型联合培养体系，提高学生的实践能力和增强学生的创新本领，促进我国药学人才培养质量的提高，带动和促进校所间科教融合、相互支持，实现产学研融合的有效推进、合作共赢。