2025年5月15日，上海药物所“药学前沿承嘏讲坛”第七十四讲在承嘏厅举行。复旦大学马剑鹏教授应邀作了题为“AI for Science——结构生物学中的计算问题：从算法到应用”的专题报告。上海药物所副所长周兵主持报告会，近200名科研人员和研究生参会。

报告中，马剑鹏以静态蛋白质结构的计算预测为切入点，深入剖析了当前AlphaFold2面临的关键瓶颈，包括模型预测结果难以评估其准确性、多序列比对方法对点突变不敏感、倾向于同源性较高蛋白的预测结果以及侧链构象预测精度较低等问题。在静态结构的实验测定方面，他重点介绍了OPUS-DSD模型，该模型显著提升了蛋白质结构在冷冻电镜中解析的分辨率。此外，马剑鹏团队还结合了PCST-SBM增强采样方法对低精度的蛋白预测结构进行了修正。整场讲座内容充实，理论与实践并重，充分展现了计算方法在结构生物学研究中的巨大潜力与实际应用价值。报告结束后，与会师生进行了深入讨论交流。周兵为其颁发了讲坛纪念证书。

马剑鹏，国际著名计算生物学家，现任复旦大学复杂体系多尺度研究院首任院长、上海人工智能实验室领军科学家。曾任美国贝勒医学院和莱斯大学终身教授，贝勒医学院冠顶教授，清华大学生命科学学院教授。美国医学生物工程学会会士，美国科学促进会会士及美国物理学会会士。致力于发展针对生物体系研究的人工智能计算方法，与实验手段相结合，解决复杂生物体系中的重要问题。在蛋白质结构预测研究中自主研发的OPUS-系列国产软件性能领跑全球，并成功搭建全链条AI-赋能新药研发的先进技术平台。获2004年Norman Hackerman化学研究奖等国际学术大奖，在Nature、Science等顶尖学术期刊发表多篇论文。2021-2024年连续入选Elsevier发布的“中国高被引学者”榜单（生物学）及斯坦福大学发布的“全球前2%顶尖科学家终身成就”榜单。

本期讲坛为陈凯先院士80华诞系列学术报告之一，由上海药物所主办，原创新药研究全国重点实验室、生命过程小分子调控全国重点实验室、药物发现与设计中心党支部和原创新药研究全国重点实验室党支部共同承办。

 上海药物所副所长周兵主持报告会

复旦大学马剑鹏教授作承嘏讲坛专题报告

周兵为马剑鹏颁发讲坛纪念证书

（供稿部门：原创新药研究全国重点实验室、生命过程小分子调控全国重点实验室、药物发现与设计中心党支部和原创新药研究全国重点实验室党支部）