获奖年度	获奖名称	主要完成人	获奖类别	获奖等级	完成单位
1998年12月	建立人癌模型系统进行抗肿瘤新药研究	张素胤、陈陵际、张家骝、丁健、张周	国家科学技术进步奖	三等奖	中国科学院上海药物研究所
1998年11月		杨玉社	明治乳业生命科学奖	科学奖	中国科学院上海药物研究所
1998年	石杉碱甲片		世界华人发明博览会奖	银牌	中国科学院上海药物研究所
1998年	表油菜素内脂		世界华人发明博览会奖	银牌	中国科学院上海药物研究所
1998/12/16	左旋千金藤碇碱对脑内多巴胺受体的双重作用机理	金国章,周启廷，陈丽娟，陈凯先，邹灵龙	中国科学院自然科学奖	二等奖	中国科学院上海药物研究所
1998/12/16	石杉碱的化学与药理研究	唐希灿、白东鲁，朱大元，嵇汝运,刘嘉森	中国科学院自然科学奖	一等奖	中国科学院上海药物研究所
1998/12/01	骨质疏松症治疗药物——阿法骨化醇的研究	沈竞康、蒋山好、余琛、周菊珍、赵正福、朱汉民、朱大元	上海市科学技术进步奖	二等奖	中国科学院上海药物研究所、重庆制药六厂、上海市黄山制药厂
1998/12/01	发现白介素-2镇痛作用、活力中心及其与阿片样（Opioid）受体结合	刘新垣、王焱、郑仲承、裴钢、蒋春雷	上海市科学技术进步奖	三等奖	中国科学院上海生物化学研究所、中国科学院上海细胞生物学研究所、中国人民解放军第二军医大学、中国科学院上海脑研究所、中国科学院上海药物研究所
1998/10/23		中国科学院上海药物研究所	1997年国际科技论文被引证数全国研究机构第十四名		中国科学院上海药物研究所
1998/10/23		中国科学院上海药物研究所	1997年SCI系统科技论文数全国研究机构第二十名		中国科学院上海药物研究所