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支撑部门
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所级公共技术中心
所公共技术中心成立旨在进一步规范和加强大型共用仪器设备及公用实验室的管理，实现大型仪器设备资源共享和整合，保障仪器设备的正常运转和合理高效使用，培养和锻炼一支具有高素质高技术的专业团队,更好地服务和支撑研究所科研工作。
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所公用实验室
为了提升科研支撑水平，研究所整合原各学科特种公共实验室，设立所公用实验室，包括放射性同位素室、公用仪器室、氢化实验室和病原微生物实验室四部分组成，服务全所的科研活动。
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实验动物室
上海药物研究所实验动物室是新药临床前实验研究的技术支撑平台，重点为我所药物安全性评价、药效学评价、药物代谢评价等研究技术平台，开展治疗恶性肿瘤、心脑血管疾病、神经精神性疾病、代谢性疾病、自身免疫性疾病等药物开发研究提供动物实验的条件保障和相关的技术服务。
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学术期刊联合编辑部
学术期刊联合编辑部出版《中国药理学报》和《亚洲男性学杂志》。
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家庭用药编辑部
《家庭用药》杂志创刊于2001年，是由中国科学院主管、中科院上海药物研究所和上海市药理学会主办的一份医药保健科普杂志。以“依靠专家，面向百姓，传播医药保健科普知识”为办刊宗旨，以“求医问药、防病治病、养生保健”为主要内容，邀请具有丰富临床经验的医药学专家亲自撰稿，为家庭读者及各类慢性病患者的求医问药和日常保健提供丰富信息和权威指导。
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标本室
标本室创建于1932年，所采集收藏的标本均源于研究所70多年来各课题科研项目的留样，总量达11万份。
